خدمات ژنوتایپینگ

آزمایشگاه ژنیران خدمات ژنوتایپینگ را با روش HRM جهت ژنوتایپینگ پلی مورفیسم های تک نوکلئوتیدی در کمترین زمان و قیمت دانشجویی ارائه می کند. تکنیک HRM و یا (High resolution melting) یک روش بسیار دقیق و حساس برای ژنوتایپینگ پلی مورفیسم های تک نوکلئوتیدی (SNP) است.

تمامی مواد و کیت های مورد استفاده آزمایشگاه ژنیران از برند های معتبر بوده و نتایج با دقت بالا ارائه می گردد. در این روش، الگوی واسرشتی قطعات DNA مورد ارزیابی قرار میگیرد.

از آنجا که کوچکترین تفاوت ها در توالی یک نوکلئیک اسید باعث تفاوت در Tm نوکلئیک اسید می شود، می توان از با مقایسه گراف ذوب قطعات متفاوت، به تفاوت در محتوای نوکلئوتیدی آن قطعات پی برد

🔴 زمان تحویل: یک روز کاری 🔴 نحوه محاسبه قیمت:

یک ران HRM:

…برای اطلاع از قیمت ها با آزمایشگاه تماس بگرید…

نحوه‌ی تحویل پروژه:

• تمامی گراف های تولید شده در آزمایش به همراه آنالیز اولیه نتایج ارائه می گردد (آزمایش HRM با استفاده از دستگاه Realtime PCR در تکرارهای دو یا سه گانه با استفاده از مسترمیکس های EvaGreen و LCgreen با کیفیت بالا از معتبرترین برندهای دنیا انجام می شود.)

خدمات جانبی:

آزمایشگاه ژنیران جهت سهولت انجام امور پژوهشی دانشجویان، آنالیز آماری دیتای حاصل از آزمایش HRM را آموزش داده و در نحوه‌ی انجام امور آنالیز آماری راهنمایی های لازم را ارائه می کند. همچنین انجام آزمایش HRM برای سایر ارگانیسم ها اعم از گیاهان و جانوران در آزمایشگاه ژنیران قابل انجام می باشد.

تجهیزات مربوط به خدمات ژنوتایپینگ

در رابطه با HRM بیشتر بدانیم…

به تنوع های تک نوکلئوتیدی در یک لوکوس مشخص در توالی DNA افراد SNP گفته می شود. اگر در یک لوکوس مشخص، بیش از 1% افراد یک جامعه یک نوکلئوتید متفاوت را داشته باشند، آنگاه این تغییر در گروه SNP قرار می گیرد.

اگر یک SNP در درون یک ژن قرار داشته باشد، آنگاه گفته می شود آن ژن دارای دو یا چند الل است. با این وجود SNP ها در هر جایگاهی از ژنوم ممکن است قرار بگیرند. SNPها باعث بروز بیماری نمی شوند اما عموما برخی از SNPها ممکن است در برخی بیماری ها مشاهده شوند. از این مشخص کردن ژنوتیپ SNPها در نمونه های مختلف حائز اهمیت است.

روش HRM(High resolution melting) یک روش بسیار دقیق برای ژنوتایپینگ SNP است. دسترسی به رنگ های برهمکنش کننده(intercalating) با DNA دورشته ای و نیز دستگاه realtime PCR امکان انجام آزمایشات ژنوتایپینگ را فراهم کرده است. در این رویکرد، از الگوی ذوب شدگی محصول PCR که حامل SNP مورد مطالعه است، استفاده می شود.

HRM یک روش Post-PCR است. در مرحله اول ناحیه ای از DNA که حامل SNP مورد مطالعه است، با استفاده از PCR تکثیر می شود. با تکثیر و ازدیاد قطعات، رنگ مورد استفاده به مولکول های DNA دو رشته ای که در طی سیکل های متناوب PCR تولید شده است، متصل می شود. پس از اتمام PCR، مرحله HRM انجام می شود.

در این فرایند، محصول PCR کم کم از 50 درجه سلسیوس تا 95 درجه سلسیوس حرارت داده شده و همزمان با این، الگوی دناتوراسیون آن توسط دستگاه ثبت می شود. با توجه به تفاوت Tm قطعات مختلف، مشاهده الگوهای متفاوت ذوب شدگی نشان دهنده حضور الل های متفاوت در لوکوس مورد مطالعه است.

به این ترتیب مشخص می شود که نمونه مورد مطالعه در آن لوکوس حاوی کدامیک از بازهای چهارگانه است. در آزمایش HRM بهتر است که از رنگ های برهمکنش کننده با DNA دورشته ای که بصورت اشباع با DNA برهمکنش می کنند استفاده شود. LCGreen و EvaGreen از رایج ترین رنگ های مورد استفاده در آنالیز HRM هستند.

🔵کاربرد های ژنوتایپینگ🔵

• ژنوتایپینگ SNP و جهش های تک نوکلئوتیدی در نمونه های مختلف

  چند شکلی تک نوکلئوتیدی یا single nucleotide polymorphism (SNP) به تغییرات تک نوکلئوتیدی در سطح ژنوم یک موجود گفته می شود. به طرق مختلفی همچون Allele Discrimination، Allele Detection و HRM می توان ژنوتایپینگ SNP و جهش های تک نوکلئوتیدی در نمونه های مختلف انجام داد.

  در روش Allele Discrimination از واکنش های بیوشیمیایی مختص آلل استفاده می شود که به طور کلی به چهار روش می توان از طریق Allele Discrimination ژنوتایپینگ انجام داد که این روش ها عبارتند از:

  1- روش توسعه ی پرایمری یا Primer extension

  2- هیبریداسیون یا Hybridization

  3- روش اتصال یا Ligation

  4- شکاف آنزیمی یا Enzymatic cleavage

  روش های Allele Detection به طرق مختلفی انجام می شود که می توان به تشخیص بر مبنای Mass-spect، تشخیص مبتنی بر سیگنال فلورسانس و کمی لومینسانس اشاره کرد.

• ژنوتایپینگ هاپلوتایپ های لوکوس های مجاور

   

برای مشاهده کامل بخش خدمات مولکولی ژنیران کلیک کنید

مطالعه در termo fisher