مهارت آموزی آنالیز داده های NGS
(DNA & RNA sequencing)
آزمایشگاه ژنیران برگزار کننده دوره کارآموزی نیمه خصوصی (کارگاه) آنالیز داده های NGS
(DNA & RNA sequencing) می باشد.
100 ساعت در 20 جلسه
کلاس های این دوره به صورت نیمه خصوصی (۵ تا ۸ نفره) برگزار میگردد.
با اعطای مدرک از آزمایشگاه ژنیران-انجمن زیست‌شناسی ایران و ITE لندن (در صورت درخواست)
شروع دوره:
- ۱۵ مرداد
- ۲۷ مهر
- ۲۸ آذر
- هزینه دوره: ۱۵ میلیون تومان
- هزینه دوره در پاییز: ۱۴ میلیون و ۹۰۰ هزار تومان
برای ثبت نام کافیست فقط 20 درصد هزینه کل را بپردازید. 80 درصد باقی مانده را می توانید در اقساط 3 ماهه با چک صیادی پرداخت کنید. اطلاعات بیشتر
سرفصل های دوره کارآموزی آنالیز داده های NGS:
- مروری بر توالی یابی نسل بعد ،کاربردها و انواع آن (بررسی پلت فرم ها)
- آموزش Linux essential و آشنایی با محیط R
- آنالیز مرحله اول (Primary Analysis) داده های NGS شامل Filtering و Trimming و معرفی فایل FASTQ
- آنالیز مرحله دوم (Secondary Analysis) داده های NGS و Alignment آن با ژنوم مرجع
- تبدیل فایل FASTQ به فایل های SAM و BAM
- Variant Calling و کنترل کیفی آن
- آنالیز مرحله سوم (Tertiary Analysis) شامل Annotation
- Filtering و Prioritization واریانت ها
- تفسیر نتایج براساس گایدلاین ACMG
- آنالیز توالی یابی سنگر
- RNA Sequencing
The course entitled “Next-Generation Sequencing Data Analysis” at Geniran laboratory covers following topics
Overview and Common Applications of NGS Technologies
Linux Essential
Library Preparation for NGS
Data Analysis for NGS:
Primary Analysis (FASTQ Filtering and Trimming)
Secondary Analysis (FASTQ Alignment, Post Alignment, Variant Calling)
Tertiary Analysis (Annotation, Filtering and Prioritization)
CNV Analysis by Read-Depth Approach
American College of Medical Genetics (ACMG) guidelines for the interpretation and reporting of SNV and CNVs in routine diagnostics
Analysis of Sanger Sequencing
RNA Sequencing and Analysis
De novo Genome Assembly
NGS (Next Generation Sequencing) شامل تکنیک های پیشرفته برای توالی یابی نوکلئوتیدها در سطح DNA و یا RNA می باشد. ابداع روش هایی برای توالی یابی از سال حدود 1977 کلید خورد که امکان رمزگشایی از نوکلئوتیدها را در مقیاس های کوچک فراهم می آورد. در طی تکمیل پروژه ژنوم انسان که بیش از یک دهه زمان برد به منظور سهولت توالی یابی تکنیک های نوینی مطرح شد که قادر بودند چندین توالی را به صورت موازی هم زمان با یک دیگر خوانش کنند که این امر به نوبه خود سرعت و قیمت را به شکل باور نکردنی کاهش داد.
از طرفی حجم عظیم داده های ایجاد شده از توالی یابی نیاز روزافزون استفاده از کامپیوتر و برنامه نویسی را در تجزیه و تحلیل و مدیریت داده ها سبب شد. این امر به نوبه خود ایجاد علم بین رشته ای بیوانفورماتیکی را سبب شد که دانستن آن امروزه برای دانشجویان و متقاضیان کار در این حیطه امری ضروری بوده چرا که به کمک این علم دروازه ای جدید از بررسی داده ها در وسعت زیاد و در نتیجه تحقق نتیجه قطعی تر و نزدیک تر به واقعیت را در سطح کل ژنوم فراهم می آورد.
آزمایشات مولکولی مبتنی بر توالی یابی نسل بعد (NGS) ، در تشخیص بیماری های تک ژنی، پزشکی سازی شخصی، ارزیابی ریسک و درمان بیماران مبتلا به سرطان انقلاب عظیمی ایجاد کرده است. همچنین از این علم در حوزه های دیگری همچون آنالیز بیان ژن و مطالعه تغییرات اپی ژنتیکی شامل متیلاسیون DNA، تعامل بین پروتئین ها با DNA و بررسی رونوشت های RNA در حال ترجمه با Ribosome Profiling استفاده می شود.
آزمایشگاه ژنیران با برگزاری کارآموزی NGS | دوره آموزشی NGS | امکان یادگیری یک علم بین رشته ای نوین که در آن تکنیک های کامپیوتری همچون کار در محیط لینوکس، نصب نرم افزارهای مربوطه، انجام گام به گام آنالیز داده های حجیم (big data) و در نهایت ارائه یک گزارش بالینی از پروسه انجام شده را برای افراد فراهم می آورد. از مزیت های مهم این دوره علاوه بر یادگیری و انجام آنالیزWhole Exome Sequencing (WES) و بررسی و تشخیص واریانت های تک ژنی بررسی واریانت های ساختاری همچون CNV ها می باشد.
همین طور در این دوره به منظور درک بهتر کارآموزان رشته های بیولوژی از مباحث کامپیوتری مقدمه ای در رابطه با برنامه نویسی آموزش داده خواهد شد. همچنین این امکان وجود خواهد داشت تا دانشجویان علاوه بر کار با سرور انجام آنالیز با کامپیوتر شخصی خود را نیز فرا گیرند. از برتری های این دوره نسبت به سایر دوره های مشابه یادگیری انجام آنالیز در سطح transcriptome و بررسی بیان ژن ها با تکنیک RNA seq می باشد.
افرادي که مسلط به آناليز داده های (Next-Generation Sequencing) NGS هستند، مي‌توانند در آزمايشگاه‌هاي ژنتيک، کارخانه‌هاي داروسازي و مراکز تحقيقاتي فعاليت کنند. همچنين دانشجویان کوشا و علاقه مند در نهایت می توانند در انجام پروژه های آنالیز با مجموعه ژنیران همکاری کنند.
دوره های کاراموزیتون که بصورت حضوری هستش معمولا ایا تا پایان تابستان تمام میشن؟
بله برای مثال دوره ngs در دو ماه تابستان تکمیل میشود
دوره ی بعدی NGS که قابل ثبت نام هسا برای چه تاریخی می باشد ؟
تاریخ شروع دوره در همین صفحه ذکر شده است
هزینه و‌سوال
هزینه در همین صفحه ذکر شده
سلام سرفصل های دوره آنالیز NGS چی هست
سلام، سرفصل ها در همین صفحه ذکر شده
سلام وقتتون بخیر.
wes و wgs روهم آموزش میدین توی این دوره؟
سلام، بله آنالیز این دو را یاد خواهید گرفت
سلام
شما برای آنالیز ترانسکریپتوم دوره ای ندارید؟
در دوره NGS این مورد آموزش داده میشود
سلام
آموزش انلاین هم دارید؟
با سلام،
دوره های آنلاین ما در منو: دوره های آنلاین ذکر شده است.
دوره آنالیز داده‌های NGS حضوری است
سلام خسته نباشید برای این دوره چه مطالبی رو باید مسلط باشیم در واقع پایه های این دوره
سلام، آشنایی با لینوکس، زبان برنامه نویسی R یا Python، دانش پایه بیولوژی و متد های آماری.
سلام در دوره ngs آموزش مشاوره ژنتیک هم وجود داره؟
سلام، خیر.
مدرس کلاسای ان جی اس رو لطف میکنید بگین؟
مدرس این دوره خانم مهسا حاتمی هستن. فارغ التحصیل رشته ژنتیک انسانی از دانشگاه شهید بهشتی به همراه 5 سال سابقه تدریس در حوزه‌های مختلف و 2 سال سابقه تدریس در حوزه NGS را دارند.
آیا امکان شرکت در کلاس های تحلیل داده NGS به صورت آنلاین هم وجود دارد؟
سلام دوست عزیز
در حال حاضر حضوری است.
سلام و وقت بخیر.
دوره ی بعدی NGS در چه تاریخی شروع می شود؟
سلام تاریخ بعدی این دوره در اردیبهشت ماه است
سلام،ببخشید شروع دوره از۲۱بهمن تا چه تاریخی،۱۱جلسه هر روز هست یا فقط جمعه ها؟
سلام دوست عزیز روز های اخر هفته ها و اکثر مواقع در جمعه ها برگزار میشود. دوره بعدی 21 بهمن شروع خواهد شد. چنانچه قصد اقدام دارید زودتر ثبت نام کنید.
سلام وقت بخیر
دوره به صورت مجازی هم برگزار می شود؟ زمان آموزش کل دوره چند روز است؟
سلام دوست عزیز ،کل دوره 11 جلسه است در در روز های آخر هفته برگزار خواهد شد. به صورت حضوری میباشد
جهت گرفتن مشاوره رایگان برای ثبت نام با ژنیران تماس بگیرید.
سلام و وقت به خیر
ساعات برگزاری دوره آنالیز NGS مشخص هیت؟ اگر بله میشه بفرمایید چه ساعتی؟
سلام ساعت های کلاس ها در روز اول کاراموزی مشخص میشوند. این دوره در آخر هفته ها خصوصا جمعه ها برگزار میشود.