سرفصل های دوره کارآموزی آنالیز داده های NGS:
The course entitled “Next-Generation Sequencing Data Analysis” at Geniran laboratory covers following topics
Overview and Common Applications of NGS Technologies
Linux Essential
Library Preparation for NGS
Data Analysis for NGS:
Primary Analysis (FASTQ Filtering and Trimming)
Secondary Analysis (FASTQ Alignment, Post Alignment, Variant Calling)
Tertiary Analysis (Annotation, Filtering and Prioritization)
CNV Analysis by Read-Depth Approach
American College of Medical Genetics (ACMG) guidelines for the interpretation and reporting of SNV and CNVs in routine diagnostics
Analysis of Sanger Sequencing
RNA Sequencing and Analysis
De novo Genome Assembly
- در تابستان دوره کارآموزی آنالیز داده های NGS روزهای زوج از ساعت 17 عصر برگزار میشود
- دوره کارآموزی آنالیز داده های NGS در تاریخ ۲۷ مهر جمعه ها برگزار میشود
- دوره کارآموزی آنالیز داده های NGS در تاریخ ۲۸ آذر روز های زوج عصر برگزار میشود
NGS (Next Generation Sequencing) شامل تکنیک های پیشرفته برای توالی یابی نوکلئوتیدها در سطح DNA و یا RNA می باشد. ابداع روش هایی برای توالی یابی از سال حدود 1977 کلید خورد که امکان رمزگشایی از نوکلئوتیدها را در مقیاس های کوچک فراهم می آورد. در طی تکمیل پروژه ژنوم انسان که بیش از یک دهه زمان برد به منظور سهولت توالی یابی تکنیک های نوینی مطرح شد که قادر بودند چندین توالی را به صورت موازی هم زمان با یک دیگر خوانش کنند که این امر به نوبه خود سرعت و قیمت را به شکل باور نکردنی کاهش داد.
از طرفی حجم عظیم داده های ایجاد شده از توالی یابی نیاز روزافزون استفاده از کامپیوتر و برنامه نویسی را در تجزیه و تحلیل و مدیریت داده ها سبب شد. این امر به نوبه خود ایجاد علم بین رشته ای بیوانفورماتیکی را سبب شد که دانستن آن امروزه برای دانشجویان و متقاضیان کار در این حیطه امری ضروری بوده چرا که به کمک این علم دروازه ای جدید از بررسی داده ها در وسعت زیاد و در نتیجه تحقق نتیجه قطعی تر و نزدیک تر به واقعیت را در سطح کل ژنوم فراهم می آورد.
آزمایشات مولکولی مبتنی بر توالی یابی نسل بعد (NGS) ، در تشخیص بیماری های تک ژنی، پزشکی سازی شخصی، ارزیابی ریسک و درمان بیماران مبتلا به سرطان انقلاب عظیمی ایجاد کرده است. همچنین از این علم در حوزه های دیگری همچون آنالیز بیان ژن و مطالعه تغییرات اپی ژنتیکی شامل متیلاسیون DNA، تعامل بین پروتئین ها با DNA و بررسی رونوشت های RNA در حال ترجمه با Ribosome Profiling استفاده می شود.
آزمایشگاه ژنیران با برگزاری کارآموزی NGS | دوره آموزشی NGS | امکان یادگیری یک علم بین رشته ای نوین که در آن تکنیک های کامپیوتری همچون کار در محیط لینوکس، نصب نرم افزارهای مربوطه، انجام گام به گام آنالیز داده های حجیم (big data) و در نهایت ارائه یک گزارش بالینی از پروسه انجام شده را برای افراد فراهم می آورد. از مزیت های مهم این دوره علاوه بر یادگیری و انجام آنالیزWhole Exome Sequencing (WES) و بررسی و تشخیص واریانت های تک ژنی بررسی واریانت های ساختاری همچون CNV ها می باشد.
همین طور در این دوره به منظور درک بهتر کارآموزان رشته های بیولوژی از مباحث کامپیوتری مقدمه ای در رابطه با برنامه نویسی آموزش داده خواهد شد. همچنین این امکان وجود خواهد داشت تا دانشجویان علاوه بر کار با سرور انجام آنالیز با کامپیوتر شخصی خود را نیز فرا گیرند. از برتری های این دوره نسبت به سایر دوره های مشابه یادگیری انجام آنالیز در سطح transcriptome و بررسی بیان ژن ها با تکنیک RNA seq می باشد.
افرادي که مسلط به آناليز داده های (Next-Generation Sequencing) NGS هستند، ميتوانند در آزمايشگاههاي ژنتيک، کارخانههاي داروسازي و مراکز تحقيقاتي فعاليت کنند. همچنين دانشجویان کوشا و علاقه مند در نهایت می توانند در انجام پروژه های آنالیز با مجموعه ژنیران همکاری کنند.
سلام وقت بخیر من تازه دوره کاراموزی ژنتیک مولکولی رو تموم کردم میتونم این دوره رو ثبتنام کنم؟ امکان ثبتنام آنلاین برای این دوره وجود دارد؟
سلام، این دوره به علت تخصصی و غیر عمومی بودن ثبت نام آنلاین ندارد و قبل از ورود به کلاس باید با شما مصاحبه شود. جهت اطلاعات بیشتر با ما تماس بگیرید
سلام وقتتون بخیر.آیا کلاس به صورت آنلاین هم تشکیل میشه؟ و این که چند جلسه در هفته هست؟آخر هفته هاست؟
خیر آنلاین برگزار نمیشود و کاملا حضوری است