کارآموزی آنالیز داده های NGS

NGS (Next Generation Sequencing) شامل تکنیک های پیشرفته برای توالی یابی نوکلئوتیدها در سطح DNA و یا RNA می باشد. ابداع روش هایی برای توالی یابی از سال حدود 1977 کلید خورد که امکان رمزگشایی از نوکلئوتیدها را در مقیاس های کوچک فراهم می آورد. در طی تکمیل پروژه ژنوم انسان که بیش از یک دهه زمان برد به منظور سهولت توالی یابی تکنیک های نوینی مطرح شد که قادر بودند چندین توالی را به صورت موازی هم زمان با یک دیگر خوانش کنند که این امر به نوبه خود سرعت و قیمت را به شکل باور نکردنی کاهش داد.

از طرفی حجم عظیم داده های ایجاد شده از توالی یابی نیاز روزافزون استفاده از کامپیوتر و برنامه نویسی را در تجزیه و تحلیل و مدیریت داده ها سبب شد. این امر به نوبه خود ایجاد علم بین رشته ای بیوانفورماتیکی را سبب شد که دانستن آن امروزه برای دانشجویان و متقاضیان کار در این حیطه امری ضروری بوده چرا که به کمک این علم دروازه ای جدید از بررسی داده ها در وسعت زیاد و در نتیجه تحقق نتیجه قطعی تر و نزدیک تر به واقعیت را در سطح کل ژنوم فراهم می آورد.

آزمایشات مولکولی مبتنی بر توالی یابی نسل بعد (NGS) ، در تشخیص بیماری های تک ژنی، پزشکی سازی شخصی، ارزیابی ریسک و درمان بیماران مبتلا به سرطان انقلاب عظیمی ایجاد کرده است. همچنین از این علم در حوزه های دیگری همچون آنالیز بیان ژن و مطالعه تغییرات اپی ژنتیکی شامل متیلاسیون DNA، تعامل بین پروتئین ها با DNA و بررسی رونوشت های RNA در حال ترجمه با Ribosome Profiling استفاده می شود.

آزمایشگاه ژنیران با برگزاری  کارآموزی NGS | دوره آموزشی NGS | امکان یادگیری یک علم بین رشته ای نوین که در آن تکنیک های کامپیوتری همچون کار در محیط لینوکس، نصب نرم افزارهای مربوطه، انجام گام به گام آنالیز داده های حجیم (big data) و در نهایت ارائه یک گزارش بالینی از پروسه انجام شده را برای افراد فراهم می آورد. از مزیت های مهم این دوره علاوه بر یادگیری و انجام آنالیزWhole Exome Sequencing (WES) و بررسی و تشخیص واریانت های تک ژنی بررسی واریانت های ساختاری همچون CNV ها می باشد.

همین طور در این دوره به منظور درک بهتر کارآموزان رشته های بیولوژی از مباحث کامپیوتری مقدمه ای در رابطه با برنامه نویسی آموزش داده خواهد شد. همچنین این امکان وجود خواهد داشت تا دانشجویان علاوه بر کار با سرور انجام آنالیز با کامپیوتر شخصی خود را نیز فرا گیرند. از برتری های این دوره نسبت به سایر دوره های مشابه یادگیری انجام آنالیز در سطح transcriptome و بررسی بیان ژن ها با تکنیک RNA seq می باشد.

افرادي که مسلط به آناليز داده های  (Next-Generation Sequencing) NGS هستند، مي‌توانند در آزمايشگاه‌هاي ژنتيک، کارخانه‌هاي داروسازي و مراکز تحقيقاتي فعاليت کنند. همچنين دانشجویان کوشا و علاقه مند در نهایت می توانند در انجام پروژه های آنالیز با مجموعه ژنیران همکاری کنند.